Налоговый орган доначислил недропользователю недоимку по налогу на добычу полезных ископаемых (НДПИ), пени и штраф (в общей сумме более 270 млн. рублей), так как пришел к выводу, что недропользователь совместно с его взаимозависимыми лицами искусственно разделил единый процесс добычи полезного ископаемого. Налоговый орган посчитал, что операции, осуществляемые с полезным ископаемым после продажи его недропользователем взаимозависимому лицу, не являются операциями по переработке полезного ископаемого в иной продукт, а являются операциями первичной обработки с целью доведения полезного ископаемого до требований товарного качества.

Такие споры часто разрешаются не в пользу недропользователя: налоговый орган доказывает, что добытым полезным ископаемым для целей исчисления НДПИ является не изначально извлекаемое из недр сырье, а продукт, получившийся в результате осуществления с ним дополнительных технологических операций.

В настоящем споре удалось доказать, что операции осуществляемые с добытым полезным ископаемым после его реализации взаимозависимому лицу, не включаются в цикл добычных работ, и полезное ископаемое еще до этих операций соответствует требованиям ГОСТ и стандарта, а после осуществления этих операций появляется сортовой продукт, который обладает своими особыми свойствами.

Как следствие, суды согласились с позицией недропользователя и признали решение налогового органа недействительным.